Ο Ιωάννης Φωτίδης είναι Επίκουρος Καθηγητής στο Τμήμα Γεωπονίας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης και μέλος του Εργαστηρίου Εναλλακτικών Ενεργειακών Πόρων στη Γεωργία. Έχει διατελέσει Αναπληρωτής Καθηγητής στο Τμήμα Περιβαλλοντικής Μηχανικής του Πολυτεχνείου της Δανίας, Αναπληρωτής Καθηγητής στην Σχολή Μηχανικής και Φυσικών Επιστημών του Πανεπιστημίου του Τάμπερε, Επίκουρος Καθηγητής στο Τμήμα περιβάλλοντος του Ιόνιου Πανεπιστημίου και Επισκέπτης Καθηγητής στην Σχολή Πολιτικών Μηχανικών του Νοτιοανατολικού Πανεπιστημίου της Κίνας. Έλαβε το διδακτορικό του δίπλωμα στη Γεωργική Μηχανική από το Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης. Τα ερευνητικά του ενδιαφέροντα επικεντρώνονται στους εναλλακτικούς ενεργειακούς πόρους στη γεωργία, στη διαχείριση αγροτοβιομηχανικών αποβλήτων, στην επεξεργασία λυμάτων, στη βιοενέργεια, στη βιοτεχνολογία, στη βιοοικονομία, στα βιοδιυλιστήρια, στην αναερόβια μικροβιακή οικολογία και στη βελτιστοποίηση της αναερόβιας χώνευσης. Μελετάει την ανάπτυξη βιώσιμων λύσεων για αποτελεσματικές διαδικασίες συγχώνευσης διαφόρων υπολειμματικών πόρων και λυμάτων. Τέλος, έχει συμμετάσχει σε εθνικά (π.χ., ΕΛΙΔΕΚ, Energinet.dk, The Danish Council for Independent Research, κ.α.) και διεθνή (π.χ., Seven Framework Program, Interreg IV, κ.α.) χρηματοδοτούμενα επιστημονικά έργα.