Ο Ιωάννης Παναγόπουλος αποφοίτησε το 2002 από το τμήμα Αξιοποίησης Φυσικών Πόρων και Γεωργικής Μηχανικής του ΓΠΑ και το 2004 απέκτησε μεταπτυχιακό δίπλωμα ειδίκευσης στην Επιστήμη και Τεχνολογία Υδατικών Πόρων από το ΕΜΠ, όπου το 2010 ολοκλήρωσε διδακτορική διατριβή στην Υδρολογία και Μη-Σημειακή Ρύπανση Επιφανειακών Υδάτων. Ακολούθησε μεταδιδακτορική έρευνα στο ΕΜΠ (2011-2012), στο Κέντρο Αγροτικής Ανάπτυξης του Πανεπιστημίου της Αϊόβα των ΗΠΑ (2012-2013), εκ νέου στο ΕΜΠ (2014-2018) και τέλος, στο Ινστιτούτο Εσωτερικών Υδάτων του ΕΛΚΕΘΕ (2018-2022), πάνω σε θέματα διαχείρισης αγροτικού νερού και γεωργικής ρύπανσης υδάτων, διαχείρισης υδάτινων οικοσυστημάτων και ανάπτυξης υποδομών για την παρακολούθηση των εσωτερικών υδάτων της χώρας. Το έτος 2022 διορίστηκε (ΦΕΚ 1094/9-5-2022 τ.Γ’) στη βαθμίδα του Επίκουρου Καθηγητή στο Τμήμα Γεωπονίας του ΑΠΘ. Βρίσκεται στο Εργαστήριο Γενικής και Γεωργικής Υδραυλικής και Βελτιώσεων του Τομέα Εγγείων Βελτιώσεων, Εδαφολογίας και Γεωργικής Μηχανικής του Τμήματος Γεωπονίας στην Πανεπιστημιούπολη του ΑΠΘ.