Ο Σπύρος Γκέλης πήρε το πτυχίο του στη Βιολογία και το διδακτορικό του δίπλωμα στο Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης. Η διδακτορική του διατριβή αφορούσε τον χαρακτηρισμό των κυανοβακτηρίων και των βιοδραστικών πεπτιδίων τους. Μέρος της διδακτορικής του διατριβής εκπονήθηκε στο Πανεπιστήμιο του Ελσίνκι της Φινλανδίας (στο εργαστήριο της καθ. Kaarina Sivonen). Από το 2009 είναι μέλος του Διδακτικού και Ερευνητικού Προσωπικού (λέκτορας, επίκουρος καθηγητής, αναπληρωτής καθηγητής και σήμερα καθηγητής) στη Τμήμα Βιολογίας του ΑΠΘ. Εκτός από την έρευνα (βλ. ερευνητικά προγράμματα) διδάσκει προπτυχιακά/μεταπτυχιακά προγράμματα σπουδών τα μαθήματα Βιοποικιλότητα, Βιοπληροφορική, Υδατοκαλλιέργειες, Εφαρμοσμένη Βοτανική κ.α.. Είναι μέλος της ειδικής επιτροπής του αγγλόφωνου ΔιΠΜΣ Applied Bioinformatics. Είναι Διευθυντής του Τομέα Βοτανικής (2022-2028) και Συντονιστής της Επιτροπής Διασφάλισης Ανταγνιστικότητας του Τμήματος-Ομάδα Εσωτερικής Αξιολόγησης.