Η Αναστασία Βακατάρη ανήκει στο Ειδικό Τεχνικό Εργαστηριακό Προσωπικό (ΕΤΕΠ) του Τμήματος Μουσικών Σπουδών του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης από το 2003. Συμμετέχει στη διδασκαλία των μαθημάτων «Εισαγωγή στη μουσική τεχνολογία/πληροφορική», «Ηλεκτρονική ενορχήστρωση στην εκπαιδευτική διαδικασία», «Τεχνικές ηλεκτρονικής ενορχήστρωσης στη μουσική παραγωγή» και «Μέθοδοι έρευνας στην ψυχοακουστική και τη γνωστική ψυχολογία της μουσικής» του προπτυχιακού προγράμματος σπουδών του Τμήματος.